将数据导入到Cytoscape 3.6.1软件

2025-06-07 22:46:43来源:分类:文学作品

将化合物、五原则靶点、基于结合胶囊信号通路的蛛网中的质量相互作用整理到Excel表格中,将数据导入到Cytoscape 3.6.1软件,模型用Network Analyzer插件构建并分析舒筋活血胶囊“化合物-靶点-信号通路”的辨析标志网络药理图。其中化合物、舒筋靶蛋白和作用通路用节点表示,活血两节点间的五原则交互关系为边,有效性赋值的基于结合胶囊公式如下,具体数值见表4。蛛网中的质量

E=20%×e0+80%×(e1+e2+e3+e4)(1)

公式中,模型E——有效性赋值;

e0——化合物对应的辨析标志关键靶点数;

e1——靶点免疫调控路径数;

e2——靶点调节炎症反应路径数;

e1——靶点调节代谢过程路径数;

e1——靶点调节细胞增殖路径数

表4

2.6基于蛛网模式构建多维特征网络

采用蛛网模式结合质量标志物筛选的五原则构建五维特征网络,通过计算回归面积来进行综合评价。舒筋

构建数学模型,活血公式如下:

公式

式中,五原则S——候选化合物的回归面积;

α——相邻两个维度之间的夹角;

P——候选化合物不同维度的得分。

舒筋活血胶囊中各味药材含有的主要化合物28个,由于原药材和复方制剂中的化学成分不同,基于化合物的传递与溯源原则,赋予可传递到制剂中的个成分数值Pi(制剂中成分)=30、Pii(非制剂中成分)=10;在配伍原则上,根据生药在复方中君臣佐使的配伍原则,赋予40个成分数值Pi(君)=30、Pii(臣)=20、Piii(佐使)=10;在特有性原则中,九个药材中的特有性成分有18个,赋予18个特有性成分数值Pi=30、非特有性成分赋值Pi=10;在有效性原则中,基于网络药理学研究方法,舒筋活血胶囊治疗骨质疏松症筛选出16个有效性成分,按照1.7(1)式计算将16个化学成分赋值,具体数值如表3所示;在可测性原则中,中国药典中九味药材中的定量成分6个赋予数值Pi=30,有文献报道其含量测定方法的化学成分赋值Pi=10;无文献报道其含量测定方法的化合物赋值Pi=0。

将数值带入到“1.8”的数学模型中,结果见表5。通过计算总分绘制“蛛网模式图”如图4所示,计算28个成分的回归面积见图5,由图可知,排名前7的成分有羟基红花黄色素A、络石苷、刺五加苷B、α-香附酮、原儿茶酸、原儿茶醛和4-甲氧基水杨醛,其中4-甲氧基水杨醛为目前舒筋活血胶囊现行标准中的指标成分。

表5表5续

图4图5

3结论

本文基于质量标志物筛选的五原则即传递与溯源、特有性、复方配伍、有效性和可测性,赋予舒筋活血胶囊中各化学成分的综合得分,绘制“蛛网模式”图,最终筛选出君药红花中的羟基红花黄色素A、臣药络石藤中的络石苷、君药槲寄生中的刺五加苷B、君药香附中的α-香附酮、君药狗脊中的原儿茶酸和原儿茶醛以及臣药香加皮中的4-甲氧基水杨醛这7个化合物为舒筋活血胶囊的关键质量标志物,可作为舒筋活血胶囊的质控指标。该方法为中药复方的指标成分选择提供参考依据,同时也为中药复方提供了一种新的质量控制模式。

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